围绕所馆办刊定位与出版环境，打造期刊数字一体化平台，构建集约化出版模式；围绕公众健康需求，建设所馆医学健康知识科普体系；建立所馆新闻发布体系，培育有影响力的信息传播品牌，扩大社会影响力。

下设科室：新闻部、健康信息传播部、《医学信息学杂志》编辑部、《医学研究杂志》编辑部、《中国卫生政策研究》编辑部。

1、新闻部

通过策划、采写、发布、宣传所馆重大事件，产出多元新闻产品，构建新闻发布体系，培育有影响力的传播品牌 ，同时做好日常新闻宣传工作及相关人员的培训工作。

2、健康信息传播部

以公众对健康信息的需求为导向，做好公众健康信息、健康信息制作与传播、人群健康素养分析等领域的关键技术研究，根据需求积极开展健康信息的收集与创造，并在实践应用中创造价值。

3、《医学信息学杂志》编辑部

围绕跟踪国际、引领国内，理论与实践相结合，普及与提高相并重的办刊宗旨。有效传播医学信息学的新理论、新方法，深入报道医学信息领域的研究进展与应用成果，精准搭建医学信息学术交流平台，积极推进我国医学信息事业发展。

4、《医学研究杂志》编辑部

坚持办刊宗旨,加强从选题、策划、组稿、审稿、编辑加工、校对、印刷等各个环节工作的全面落实，实施科学的编辑出版流程，严格按照规定的出版日期出刊,不断提高期刊的影响力和竞争力。

5、《中国卫生政策研究》编辑部

紧紧围绕我国卫生改革发展的中心任务和亟待解决的重大理论与现实问题，及时报道国内外卫生政策研究的最新成果和卫生改革发展的新鲜经验，促进卫生政策研究成果的传播利用及卫生政策研究者与决策者的交流合作，为政府科学决策、改进卫生绩效和促进卫生事业发展提供重要学术支撑。