2014年11月5日，国家新型农村合作医疗电子文件管理信息系统试点工程竣工验收会议在国家卫生计生委召开，国家电子文件管理部际联席会议办公室主任、中央办公厅机要局局长魏允韬同志出席并主持会议，国家电子文件管理专家委员会副主任任守信、国家卫生计生委办公厅主任于学军等出席了会议。医科院信息所代涛所长代表项目组汇报了试点工程建设情况，并演示了信息系统。
根据《国家电子文件管理工作规划（2011-2015年）》，中共中央办公厅、国务院办公厅选定包括原卫生部在内的7个部委、5个省、2家央企开展电子文件管理试点工程建设。国家新农合电子文件管理信息系统建设项目于2012年6月由国家发展和改革委员会正式立项，原卫生部承担，中国医学科学院医学信息研究所负责具体实施。经过两年的建设，构建了新农合电子文件管理标准规范和规章制度体系，研发了新农合电子文件管理信息系统，改造了原有的国家新农合信息平台、省级新农合信息平台、医院信息系统、数据交换中心和应用支撑平台，并在跨省就医费用核查中得到了应用。
项目验收委员会和验收专家组围绕标准规范研制、系统部署、试点应用和电子文件安全技术应用等进行了质询，一致认为该项目设计合理、组织规范，有效地促进了新农合电子文件的科学管理和服务，为在全国卫生计生行业推动电子文件管理提供了重要的示范作用，完成了项目全部建设内容，同意通过竣工验收。
于学军主任在讲话中表示，感谢国家电子文件管理部际联席会议对国家卫生计生委的信任和支持、感谢医科院信息所的精心实施。新农合是卫生计生行业一项重要的民生工程，惠及8亿多参合农民，通过新农合电子文件试点工程的建设，有效降低了参合农民跨省就医费用报销的难度，取得了实效。下一步要更好地总结试点工程的经验，在卫生计生行业进行推广。
魏允韬主任进行了总结讲话，首先祝贺国家新农合电子文件管理信息系统试点工程取得的成果，对试点工程带来的社会效益、经济效益给予高度肯定，认为该试点工程切切实实的将电子文件管理与行业特点相结合，充分利用电子文件管理的手段解决了实际工作中的问题，使电子文件管理落到实地。
项目实施组负责人代涛所长表示，在国家卫生计生委的领导下，项目组将进一步扩大新农合电子文件管理信息系统的应用范围，并与国家新农合信息平台紧密结合，将电子文件管理应用到跨省就医异地结报和即时结算中，使参合农民得到更大受益。
